“黑臭在水里，根源在岸上，關鍵在排口，核心在管網”。然而，當前不少城市由于各類排水口、排水管道與檢查井的建設和維護不當，導致大量地下水等外來水會通過排水口、管道和檢查井的各種結構性缺陷進入埋設在地下水位以下的排水管道中，加之雨污混接和污水直排，削弱了“控源截污”措施應有的作用，成為制約黑臭水體整治工作的瓶頸；同時，也造成污水處理廠進水濃度偏低，導致城市排水系統應有的排水和治污功能不能充分發揮。埋設在地下水位以上的排水管道，因其缺陷還會導致污水外滲，這也是造成管道周邊地下水及土壤污染、道路路面塌陷的原因之一。

因此，亟需通過排水口改造、排水管道建設和完善、排水管道及檢查井各類缺陷修復、雨污混接改造、排水設施管理強化等一整套措施，實現消除旱天污水直排、削減雨天溢流，提升污水處理效益、減少污水外滲，降低系統運行水位、恢復截流倍數等多重目標。

具體來說，水體發生黑臭的主因有如下幾方面：

一是外源有機物和氨氮消耗水中氧氣。城市水體一旦超量受納外源性有機物以及一些動植物的腐殖質，如居民生活污水、畜禽糞便、農產品加工污染物等，水中的溶解氧就會被快速消耗。當溶解氧下降到一個過低水平時，大量有機物在厭氧菌的作用下進一步分解，產生硫化氫、胺、氨和其他帶異味易揮發的小分子化合物，從而散發出臭味。同時，厭氧條件下，沉積物中產生的甲烷、氮氣、硫化氫等難溶于水的氣體，在上升過程中攜帶污泥進入水相，使水體發黑。

二是內源底泥中釋放污染。當水體被污染后，部分污染物日積月累，通過沉降作用或隨顆粒物吸附作用進入到水體底泥中。在酸性、還原條件下，污染物和氨氮從底泥中釋放，厭氧發酵產生的甲烷及氮氣導致底泥上浮也是水體黑臭的重要原因之一。有研究指出，在一些污染水體中，底泥中污染物的釋放量與外源污染的總量相當。此外，城市河道中有大量營養物質，導致河道中藻類過量繁殖。這些藻類在生長初期給水體補充氧氣，在死亡后分解礦化形成耗氧有機物和氨氮，而這導致季節性水體黑臭現象并產生極其強烈的腥臭味道。

三是不流動和水溫升高的影響。喪失生態功能的水體，往往流動性降低或*消失，直接導致水體復氧能力衰退，局部水域或水層虧氧問題嚴重，形成適宜藍綠藻快速繁殖的水動力條件，增加水華暴發風險，引發水體水質惡化。此外，水溫的升高將加快水體中的微生物和藻類殘體分解有機物及氨氮速度，加速溶解氧消耗，加劇水體黑臭。